仙居工業特色鮮明，現已形成醫藥化工、工藝美術、機械橡塑、有色金屬冶煉壓延加工為主導行業的特色制造業。醫藥化工行業已形成甾體藥物及其中間體、中成藥、計生類藥、化學農藥等四大特色產品系列，是全國重要的醫藥中間體產品出口基地縣，主導產品激素類藥物出口居全國第一。工藝美術行業擁有工藝品企業723家，生產竹木、白銀、鐵制、布制、塑料、玻璃、彩石等15大類10000 多個規格品種的工藝品，產品遠銷世界100多個國家和地區，其中木制工藝品產量和出口量均居全國首位，是全國最大的工藝品出口基地縣，榮獲“中國工藝禮品之都”和“中國工藝禮品城”稱號。

竹木工藝品加工是仙居的一大傳統優勢產業，目前已形成了省批特色竹木工藝品加工基地一個(工藝品加工園)，規劃總面積4平方公里，其中：處于縣域規劃區中有規劃面積3平方公里，計劃總投資15億元，已累計投入資金7.46億元，已征用土地2300畝。整個園區分兩期實施，水、電、路、排污等基礎設施全部完工;另有竹木工藝品加工基地三期橫溪工業園區規劃面積1平方公里，計劃總投資5億元，已投入資金1.6億元，已征用土地622畝。整個特色園區已初具規模，環境保護符合達標要求。目前基地已成立管理委員會，并出臺了一系列完善的管理制度和服務手段，具備了良好的投資環境，被中國工藝美術行業協會命名為中國工藝品城。

基地內企業以木制工藝品、木制玩具、木制家具、竹木櫥具等為代表，產品共10幾大門類，上千個品種。據統計，2006年加工基地內共有竹木工藝品加工企業310家，占基地企業數的69.5%;從業人員1.6萬多人，占基地全部從業人員數的75.8%;實現工業總產值24.7億元，占基地工業總產值的70.0%;工業增加值6.2億元，占基地工業增加值的73.2%;實現利稅總額2.5億元，占基地利稅總額的72.9%。企業的發展極大地促進了社會經濟的協調、可持續發展，逐步形成了農戶——基地——農戶的良性循環。據統計，仙居縣僅竹木工藝品加工業就帶動了周邊農戶5萬多戶，人均年收入在9000元左右，農戶增收致富效果明顯，極大地支持了仙居的社會主義新農村建設。目前，基地內企業的生產技術水平不斷提高，大部分的企業都建立了研發中心，并配備了專業的研究人員。基地內有省級農產品加工示范企業2家;省級農業龍頭企業3家，市級19家，縣級18家。企業品牌建設有序推進，全縣竹木工藝品加工企業共列入省名牌產品2個，省著名商標2件，市名牌產品4個，市著名商標4件。